Editorial Board

Bacillus velezensis YP2 균주는 양평의 토마토 잎을 마쇄하여 80^oC에서 10분간 처리한 후 1/10 trypticase soy agar(TSA, Bacto Tryptone 15 g, Bacto Soytone 5 g, NaCl 5 g, Agar 15 g/L) 배지에 도말하여 25^oC에서 2일간 배양한 다음, 분리하여 TSA 배지에 다시 획선배양하여 재분리한 후, TSA 배지에서 28^oC에서 2일간 배양한 후 균체를 멸균한 글리세롤 20%액에 넣고 -20^oC에 보관하면서 계대 배양하여 사용하였으며, 국립농업과학원에 기탁하여 KACC92130P 수탁번호를 받았다.

Bacillus velezensis YP2 균주를 Luria-Bertani 액체배지(LB, tryptone 10 g, yeast extract 5 g, NaCl 10 g)를 사용하여 미리 배양한 균주를 2% (v/v)으로 접종하여 28^oC, 180 rpm으로 조절한 진탕배양기에서 48시간 배양하여 사용하였다.

식물병원균 Cercospora sp. 1~3, Septoria sp., Colletotrichum sp., Sclerotinia sclerotiorum, Phoma sp., Botrytis cinerea를 potato dextrose agar (PDA, Potato 200 g, Dextrose 20 g, Agar 15 g/L) 배지에 이식 후 Cercospora sp. 1~3, Septoria sp., Colletotrichum sp., Phoma sp. 균주는 25^oC에서 Sclerotinia sclerotiorum, Botrytis cinerea 균주는 20^oC에서 각각 7~25일간 배양하여 직경 5 mm 코르크보러를 이용하여 병원균의 균총을 PDA 배지가 분주된 일회용 페트리디쉬 중앙에 치상하였다. YP2 균주는 TSA 평판배지에 배양하여 루프를 이용하여 균을 떼어내어 PDA 배지가 분주된 일회용 페트리디쉬 3개소에 치상하여 병원균별로 25^oC와 20^oC 항온기에서 7~20일간 배양 후 저지원의 직경을 조사하였다.

YP2균주의 계통분류학적 동정은 일반적으로 사용되는 16S rRNA 유전자의 염기서열을 사용하였고, 추가로 Bacillus spp.의 분류에 유용한 것으로 알려진 DNA gyrase유전자(gyrB 유전자)의 염기서열을 이용하여 선발균주의 분류학적 위치를 분석하였다(Wang et al., 2007). YP2 균주는 TSB(Difco, Detroit, MI, USA)배지에 접종하여 30^oC에서 24시간 이상 배양 후 원심분리하여 균체를 수거하였다. Genomic DNA는 Genomic Plus DNA Prep kit (Inclone, Yongin, Korea)를 이용하여 추출하였다. 16S rRNA 유전자의 증폭을 위해 범용 프라이머인 27F와 1492R을 사용하였고, gyrB 유전자의 증폭을 위해 범용 프라이머인 UP-1과 UP-2r을 사용하여 PCR한 후 각각 유전자의 증폭산물을 얻었다(Yamamoto et al., 1955; Song et al., 2004). 3개의 프라이머(518F; CCAGCAGCCGCGGTAATACG, 800R; TACCAGGGTAT CTAATCC, 984F; ACGCGARGAACCTTAC)를 이용하여 16S rRNA 유전자의 염기서열을 결정하였고, gyrB 유전자는 두 개의 염기서열 분석용 프라이머(UP-1S; GAA GTC ATC ATG ACC GTT CTG CA, UP-2Sr; AGC AGG GTA CGG ATG TGC GAG CC)를 이용하여 제노텍(GenoTech, Daejeon, Korea)에 분석 의뢰하였다. 얻어진 염기서열은 SeqMan (DNASTAR, Madison, WI, USA)을 이용하여 직접 오류를 검정하고 연결하였다. 각 유전자의 비교분석을 위해서 16S rRNA 유전자의 염기서열 및 균주간 상동성은 EzTaxon (http://www.ezbiocloud.net/eztaxon)을 통해서 얻었으며(Kim et al., 2012), gyrB 유전자의 염기서열은 GenBank(www.ncbi.nlm.nih/genbank)를 통하여 얻었다. 계통도의 작성을 위해 MEGA 5.0 프로그램의 Clustal W 프로그램으로 염기서열을 정렬하고 염기서열 길이를 맞추었다. 계통도를 작성하기 위해 neighbor-joining 알고리즘을 사용하였으며, 계통도의 신뢰성을 확보하기 위해 1,000회 반복 bootstrapping을 수행하였다(Tamura et al., 2011).

청겨자(아시아종묘) 종자를 흑색비닐포트(직경 9.6 cm)에 바로커상토(서울바이오)를 담아서 파종하여 20일간 생육한 청겨자에 흰가루병이 자연 발생한 다음, YP2 균주를 LB 배지에서 28^oC에서 200 rpm으로 48시간 진탕 배양하여 배양액을 10배 희석하여 구당 10주씩 3반복으로 7일 간격으로 3회 분무 처리하여 최종 처리 7일 후 병반면적율(%)을 육안으로 달관조사하였다.

적겨자(아시아종묘) 재배중에 흰가루병이 자연 발생한 초기에 LB 배지에서 배양한 YP2 균주의 배양액을 10배 희석하여 구당 15주씩 3반복으로 5일 간격 4회, 7일 간격 3회와 10일 간격 2회 분무 처리하여 최종 처리 10일 후 병반면적율(%)을 육안으로 달관조사하였다. 대조구는 시판 미생물제를 500배 희석하여 7일 간격 3회 처리하였다.

적겨자 종자발아의 영향을 조사하기 위하여 YP2 균주를 LB액체 배지에 25^oC, 200 rpm에서 48시간 진탕배양 후 원심분리하여 균체를 회수 후 hemacytometer (Bright-Line, USA)로 계수하여 1×10⁸ cell/ml로 조절하여 적겨자 종자를 1시간 침지 후 100립씩 5반복으로 페트리디쉬에 치상하여 25^oC도 항온기내에서 3일간 보관한 다음 종자발아율(%)를 조사하였다.

적겨자 생육촉진 효과는 YP2 균주를 LB 액체 배지에 25^oC, 200rpm에서 48시간 진탕배양한 후 원심분리하여 균체를 회수하여 1.0×10⁸ cell/ml로 농도를 조절하였다. 적겨자 종자를 BM-6 상토에 파종하고, 파종일로 부터 7일 간격으로 50 ml 씩 4회 관주처리하였다. 100립씩 5반복으로 실험하였으며, 최종 처리 8일 후에 반복당 20주씩 초장, 근장과 생체중을 각각 조사하였다.

쌈채류에서 분리한 식물병원균 Cercospora sp. 1~3, Septoria sp., Colletotrichum sp., Phoma sp., Botrytis cinerea, Sclerotinia sclerotiorum에 대한 B. velezensis YP2 균주의 군사생장 억제효과를 조사한 결과에서 Cercospora sp. 1~3에 대하여 8.3~8.8 mm, Septoria sp.에 대하여 4.4 mm, Colletotrichum sp.에 대하여 5.8 mm, Phoma sp.에 대하여 8.5 mm, Botrytis cinerea에 대하여 6.1 mm, Sclerotinia sclerotiorum에 대하여 5.9 mm의 균사생육을 저지하였다(Table 1). Bacillus 균주는 cyclic lipopeptides (bacillomycin D, fengycin, iturin, surfactin), siderophore (bacillibactin), polyketides (bacillaene, difficidin, macrolactin), dipeptide(basilysin), acetoin, 2,3-butandiol 등의 이차대사물질을 생산하는 것으로 보고되었으며(Lee et al., 2012; Soumitra et al., 2015), 이러한 이차대사물질들이 식물 병원 세균이나 곰팡이의 생장과 포자발아를 억제 및 저항성 유도 등으로 식물 병 방제가 가능하며 본 연구에서 선발된 균주도 식물 병원균의 균사 생육억제와 관련 유전자를 지니고 있다고 추정된다.

16S rRNA와 gyrB 유전자를 바탕으로 MEGA5 프로그램을 이용하여 분자유전학적인 계통도를 작성하고, 선발 균주의 분류학적 위치를 확인하였다(Fig. 2). 16S rRNA 유전자를 바탕으로 작성한 계통도에서 YP2 균주는 Bacillus velezensis BCRC 17467(T) 균주와 높은 상동성(100%)을 보였다(Fig. 1A). B. siamensis 균주와는 계통도의 신뢰성을 확보하기 위한 bootstrap 값도 81%로 비교적 높은 값을 보였다. YP2 균주는 gyrB 유전자를 바탕으로 작성한 계통도에서 B. amyloliquefaciens subsp. plantarum 균주에 높은 상동성(100%)을 보였으며, 99%의 Bootstrap 값을 보이며 높은 계통도의 신뢰성을 보였다(Fig. 1B). 최근 계통유전체학을 근거로 한 Bacillus spp.의 분류연구는 근연종 Bacillus 4종, 즉 B. amyloliquefaciens subsp. plantarum, B. methylotrophicus, B. oryzicola, 및 B. velezensis를 모두 B. velezensis로 분류되어야 한다고 보고된바 있다(Dunlap et al., 2016). 본 연구의 선발 균주인 YP2 균주는 16S rRNA와 gyrB 유전자를 이용하여 분석한 결과 Dunlap 등의 보고에 따라 B. velezensis로 동정되었으며, YP2균주를 배양하여 현미경상에서 세균이다(Fig. 2).

Fig. 1. 
Phylogenetic dendrogram based on partial 16S rRNA (A) and gyrB (B) gene sequences (1,416 bp and 1,065 bp, respectively) of Bacillus strains. Numbers above branches indicate bootstrap values (>50%) from 1,000 replicates. Strain or culture collection and accession numbers are indicated next to species name. T means type strain.

Fig. 2. 
Morphology of cells of B. velezensis YP2 by microscopy (Leica DM2500).

20일간 생육한 청겨자에 흰가루병이 발생한 초기에 YP2 균주를 LB배지에서 배양한 배양액을 10배 희석하여 7일 간격으로 3회 분무 처리한 결과, YP2 균주는 적겨자에 처리하여 흰가루병이 5.3% 병반면적율을 나타내어 91.8% 방제 효과를 보였으며, 청겨자에 대해서는 청겨자에 대해서는 흰가루병 병반면적율이 14.2%로 80.9%의 높은 방제 효과를 나타내었다(Table 2).

적겨자 흰가루병이 발생한 초기에 LB 배지에서 배양한 YP2 균주의 배양액을 10배 희석하여 5일 간격 4회, 7일 간격 3회와 10일 간격 2회 분무 처리한 결과에서 5일 간격 4회 처리구가 흰가루병 발생이 24.6%로 70.6% 가장 높은 방제 효과를, 7일 간격 3회 처리구는 29.3%의 흰가루 병 발생하여 65.0% 방제 효과를 보인 반면에 10일 간격 2회 처리구는 흰가루병 발생이 49.5% 발생하여 40.9%의 낮은 방제효과를 나타내었다(Table 3, Fig. 3). 10일 간격 2회 처리구의 낮은 방제 효과는 흰가루병균의 분생포자가 식물체에 부착하여 발아되어 5일~6일이면 한 세대가 경과하여 다시 분생포자가 형성되어 매우 빠른 속도로 분생포자세대를 유지하면서 식물체에 피해를 주어(Endo, 1989) 새로운 흰가루병균 포자가 비산되어서 병 발생하는 생활사와 깊은 연관이 있을 것으로 생각된다.

Fig. 3. 
Control effect of red leaf mustard powdery mildew by the cultured broth of B. velezensis YP2 at interval and frequency of application. A; 5 days interval 4 times treatment, B; 7 days interval 3 times treatment, C; 10 days interval 2 times treatment, D; untreated check.

Bacillus pumilus와 Bacillus subtilis 균주가 식물병 방제에 효과가 인정되어 미국의 아그라퀘스트사에서 흰가루병 등 방제제로 개발하여 세레나데, 랩쏘디와 쏘나타라는 미생물농약 제품으로 등록하여, 미국, 독일, 스위스, 페루, 캐나다 이태리와 프랑스 등에서 사용되고 있다(Helene et al., 2011). 국내에서는 B. amyloliquefaciens M27 (Lee et al., 2013), B. subtilis B29, B. subtilis M10과 Streptomyces sp. CC19 균주가 오이 흰가루병에 효과적인 균주로서 선발한 바 있으며(Lee et al., 2010), 그리고 Bacillus sp. BS061 균주의 20배 희석한 배양여액은 오이 흰가루병을 62.4% 방제하였으며, 딸기흰가루병을 80.3% 방제효과를 나타내었다(Kim et al., 2013). 그리고 B. subtilis가 생성한 항균물질 이투린과 펜기신이 오이 흰가루병균(Podosphaera fusca)에 대한 길항력에 큰 주요 역할을 보고한 바 있다(Romero et al., 2007).

적겨자의 종자발아에 미치는 영향을 조사한 결과에서 YP2 균주 처리가 종자발아율이 81.4%로 무처리 75.6%보다 5.8% 종자 발아율이 증가되었으며, 적겨자의 생육촉진을 조사한 결과에서는 초장은 10.8 cm과 생체중이 2.1 g으로 무처리에 비하여 각각 127.1%, 190.9% 각각 증가되었다(Table 4). 바실러스 균주의 식물체의 생육촉진에 관여하는 일차대사물질에서 2,3-butandiol과 IAA 생성 유전자가 가지고 있다고 밝혀져서(Lee et al., 2012; Soumitra et al., 2015), YP2 균주도 이런 유전자를 가지고 있다고 추정된다.

이상의 결과에서와 같이 B. velezensis YP2 균주는 겨자채 흰가루병에 방제효과가 우수하며, 종자 발아를 향상시키고 생육을 촉진하는 특성을 가지고 있어 친환경재배에 사용될 수 있는 우수한 균주라고 사료된다.